Биологи предложили метод количественного анализа молекул ДНК и РНК,
присутствующих в изучаемых образцах в небольшом количестве. По словам
исследователей, их открытие позволит увеличить точность при изучении
таких молекул в отдельных клетках, а также редких (то есть
присутствующих в небольшой концентрации) мРНК. Статья ученых появилась в журнале Nature Methods.
При работе с образцами генетического материала часто бывает необходимо
изучать ДНК или РНК, которые присутствуют в образцах в небольшом
количестве. Чтобы "усилить сигнал" ученые обычно копируют изучаемые
молекулы и их фрагменты, доводя их количество до приемлемого для
статистических методов анализа. При этом, во-первых, методы копирования
являются преимущественно стохастическими, то есть количество и качество
копий зависит от конфигурации молекул, а, во-вторых, теряется информация
о первоначальной конфигурации.
В рамках нового метода ученые, по их собственному утверждению,
преодолели обе эти трудности, снабдив скопированные молекулы
специальными метками, которые они назвали уникальными идентификаторами
молекулы (UMI). Всего было создано несколько таких идентификаторов -
одним, например, была случайная последовательность нуклеотидов, которую
присоединяли к концам изучаемых фрагментов ДНК.
Таким образом исследователям удалось подсчитать количество разных фрагментов РНК, выделенных из клетки Drosophila melanogaster.
Ученые отмечают, что их метод совместим с большинством существующих,
поэтому, в теории, позволит значительно увеличить точность проводимых
исследований. Также авторы работы отмечают, что методика пригодна для
наблюдения за другими типами молекул - вирусами, белками и прочими.
В феврале 2011 года в Science появилась статья, в которой авторы предостерегли
общественность от надувающегося "генетического пузыря" (термин,
позаимствованный у экономистов). В частности, они говорят, что с
генетическими технологиями в медицине связано большое количество
чрезмерно оптимистических ожиданий - использование подобных технологий
пока является делом далекого будущего. Из-за этого важные результаты в
этой области часто трактуются просто неверно.
http://lenta.ru/news/2011/11/21/metka/
|